Manu Ayerdi fue presidente del Napar Buru Batzar desde 2012 hasta 2015. Entre el 23 de julio de 2015 y el 7 de agosto de 2019 ejerció como primer Vicepresidente del Gobierno de Navarra y Consejero de Desarrollo Económico, bajo la presidencia de Uxue Barkos. A partir del 7 de agosto de 2019 funge como consejero de Desarrollo Económico y Empresarial del Gobierno de Navarra.
